Впервые собран полный геном двух вирусов вишни

Сотрудники НИЦ «Курчатовский институт» и МГУ им. М.В. Ломоносова провели секвенирование и собрали полные геномы распространённых вирусов вишни и черешни, впервые выявленных на территории России. Результаты работы опубликованы в международном научном журнале Plants.

Персик, абрикос, слива, вишня — не только вкусные и полезные лакомства, но и важная часть экономики. Плодоводство — большая отрасль сельского хозяйства, а косточковые занимают в ней солидную нишу. При этом на их урожайность и качество плодов влияют различные вирусные заболевания. А вегетативное размножение, применяемое при выращивании этих культур, способствует распространению вирусов от растения к растению, и так вирусы захватывают новые регионы.

Ученые описали более пятидесяти вирусов, поражающих косточковые культуры, причем благодаря новым методам высокопроизводительного секвенирования этот список постоянно расширяется. Некоторые из этих возбудителей наносят ощутимый экономический ущерб.

Например, вирус мелкоплодности (little cherry virus 1, LChV1) снижает урожайность и качество плодов. Учёные пытаются понять природу этого вируса и предотвратить его распространение. Однако до сих пор не удалось ни определить насекомых-переносчиков LChV1, ни вывести сорта вишни и черешни, устойчивые к этому возбудителю, ни разработать препарат для лечения этой болезни.

Учёные НИЦ «Курчатовский институт» и МГУ им. М.В. Ломоносова провели мониторинг вирусных заболеваний плодовых деревьев коллекции Никитского ботанического сада (Национальный научный центр РАН) в Крыму, где произрастают богатейшие коллекции плодовых культур — как местных сортов, так и завезённых из Северной Америки, Южной Европы и Центральной Азии. Исследование выявило присутствие в том числе и LChV1. Также в ходе обследования был обнаружен вирус CVA (cherry virus A). Это один из самых распространённых в мире вирусов косточковых (его обнаруживают также на персиках, абрикосах), при этом чётко определить его связь с какими-либо патологиями растений пока не удалось. CVA передается от растения к растению при прививании и вегетативном размножении.

В лаборатории геномики эукариот Курчатовского геномного центра выполнили секвенирование и впервые собрали полные геномы российских вирусов CVA и LChV1. «Оба вируса были обнаружены на многих косточковых культурах по всему миру, но никогда не выявлялись в России. Наше исследование впервые показало присутствие вирусов CVA и LChV1 в коллекции косточковых культур Никитского ботанического сада», — сообщила Светлана Цыганкова, начальник лаборатории геномики эукариот Курчатовского геномного центра.

Результаты работы российских учёных расширяют информацию о географическом распространении и генетическом разнообразии вирусов и могут помочь в разработке методов борьбы с ними.

Работа выполнена при поддержке Российского научного фонда, грант № 23-16-00032.

Источник: Официальный канал РАН.